Aninhado 'aplicativo' do ASP.NET no IIS herdando valores de configuração pai?

Atualmente, tenho 2 aplicativos da Web ASP.NET 3.5 no IIS7 (vamos chamá-los de WebParent e WebChild).

O WebChild está aninhado na lista WebParent no IIS7 e é configurado como um aplicativo (em vez de apenas um diretório virtual no WebParent). Atualmente, ambos usam seu próprio pool de aplicativos (Clássico).

O WebParent e o WebChild têm seus próprios arquivos web.config totalmente definidos em seus próprios diretórios raiz.

Eu supus que, vendo como WebChild, seja definido como um 'Aplicativo' no IIS, ele não herdaria nada do arquivo de configuração do WebParent. No entanto, apesar dessa configuração, estou vendo erros relacionados a vários elementos dentro do web.config já sendo definidos (o que é correto, existem alguns itens nos dois arquivos de configuração, mas achei que deveriam ser tratados de forma completamente independente de um) outro)?

Alguém pode esclarecer por que isso pode estar ocorrendo?

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