Estoy usando un marco de datos con muchosNA valores. Si bien puedo crear un modelo lineal, posteriormente no puedo alinear los valores ajustados del modelo con los datos originales debido a los valores faltantes y la falta de columna de indicador.

Aquí hay un ejemplo reproducible:

library(MASS)
dat <- Aids2
# Add NA's 
dat[floor(runif(100, min = 1, max = nrow(dat))),3] <- NA
# Create a model
model <- lm(death ~ diag + age, data = dat)
# Different Values
length(fitted.values(model))
# 2745
nrow(dat)
# 2843