Tengo un script que genera un script de inserción o actualización de SQL dependiendo de varios factores. A continuación se muestra el valor de cadena del script que está generando:

INSERT INTO AAB_EVENT_SHIFTS ( EVENT_ID ,SHIFT ,START_TIME ,END_TIME 
    ,CREATE_USER ,CREATE_DATE ,MODIFY_USER ,MODIFY_DATE ) VALUES ( 6 ,1 
    ,STR_TO_DATE('04/01/2016 10:00 am', '%m/%d/%Y %I:%i %p' ) 
    ,STR_TO_DATE('04/01/2016 11:00 am', '%m/%d/%Y %I:%i %p' ) ,14 ,now() ,14 ,now() 
    ); INSERT INTO AAB_EVENT_SHIFTS ( EVENT_ID ,SHIFT ,START_TIME ,END_TIME ,CREATE_USER ,CREATE_DATE ,MODIFY_USER ,MODIFY_DATE ) VALUES ( 6 ,2 ,STR_TO_DATE('04/01/2016 11:00 am', '%m/%d/%Y %I:%i %p' ) ,STR_TO_DATE('04/01/2016 12:00 pm', '%m/%d/%Y %I:%i %p' ) ,14 ,now() ,14 ,now() ); 
INSERT INTO AAB_EVENT_SHIFTS ( EVENT_ID ,SHIFT ,START_TIME ,END_TIME ,CREATE_USER ,CREATE_DATE ,MODIFY_USER ,MODIFY_DATE ) VALUES ( 6 ,3 
,STR_TO_DATE('04/01/2016 12:00 pm', '%m/%d/%Y %I:%i %p' ) 
,STR_TO_DATE('04/01/2016 1:00 pm', '%m/%d/%Y %I:%i %p' ) ,14 ,now() ,14 ,now() );

Si ejecuto eso en un editor sql conectado a la base de datos, funciona perfectamente bien e inserta todas las filas esperadas. Sin embargo, al llamar a esa consulta de esta manera:

$result = mysqli_query($link,$query);

echo mysqli_error($link);

devuelve esto:

You have an error in your SQL syntax; check the manual that corresponds to your MariaDB server version for the right syntax to use near 'INSERT INTO AAB_EVENT_SHIFTS ( EVENT_ID ,SHIFT ,' at line 24

Cambié la forma en que se genera la consulta de crear una cadena concatenada de múltiples consultas a crear una matriz de consultas y ejecutarlas una a la vez; esto parece haber corregido el problema.

        for($i=1;$i<=$event->total_shifts($event_id);$i++) {
//        echo $event->shift_exists($event_id,$i).'-'.$i.'::<P>';
        if($event->shift_exists($event_id,$i)) {
            $query[$i] =
            'UPDATE AAB_EVENT_SHIFTS '
                    . 'SET START_TIME   = STR_TO_DATE(\''.$event->event_date($event_id).' '.$_POST['start_shift-'.$i].'\', '.'\'%m/%d/%Y %I:%i %p\' )'
                    . ', END_TIME       = STR_TO_DATE(\''.$event->event_date($event_id).' '.$_POST['end_shift-'.$i].'\', '.'\'%m/%d/%Y %I:%i %p\' )'
                    . ',MODIFY_USER     = '. get_session_user_id(session_id())
                    . ',MODIFY_DATE     = now()'
                    . ' WHERE EVENT_ID = '.$event_id.' AND SHIFT = '.$i.'; ';

        } else { $query[$i] =
                '
        INSERT INTO AAB_EVENT_SHIFTS
        (
        EVENT_ID
        ,SHIFT
        ,START_TIME
        ,END_TIME
        ,CREATE_USER
        ,CREATE_DATE
        ,MODIFY_USER
        ,MODIFY_DATE
        )
        VALUES
        (
        '.$event_id.'
        ,'.$i.'
        ,STR_TO_DATE(\''.$event->event_date($event_id).' '.$_POST['start_shift-'.$i].'\', '.'\'%m/%d/%Y %I:%i %p\' )
        ,STR_TO_DATE(\''.$event->event_date($event_id).' '.$_POST['end_shift-'.$i].'\', '.'\'%m/%d/%Y %I:%i %p\' )            
        ,'. get_session_user_id(session_id()) .'
        ,now()
        ,'. get_session_user_id(session_id()) .'
        ,now()
        ); 
        ';

        }
        }

        $i = 1;
        while($query[$i]) {
        echo '<P>'.$query[$i];
            $result = mysqli_query($link, $query[$i]);
            $i++;
        echo '<P>'.mysqli_error($link);
        }