Procrustes Análisis con NumPy?
¿Hay algo como el de Matlab?procrustes
¿Funciona en NumPy / SciPy o bibliotecas relacionadas?
Para referencia. El análisis de Procrustes apunta a alinear 2 conjuntos de puntos (en otras palabras, 2 formas) para minimizar la distancia cuadrada entre ellos mediante la eliminación de los componentes de distorsión de escala, traslación y rotación.
Ejemplo en Matlab:
X = [0 1; 2 3; 4 5; 6 7; 8 9]; % first shape
R = [1 2; 2 1]; % rotation matrix
t = [3 5]; % translation vector
Y = X * R + repmat(t, 5, 1); % warped shape, no scale and no distortion
[d Z] = procrustes(X, Y); % Z is Y aligned back to X
Z
Z =
0.0000 1.0000
2.0000 3.0000
4.0000 5.0000
6.0000 7.0000
8.0000 9.0000
La misma tarea en NumPy:
X = arange(10).reshape((5, 2))
R = array([[1, 2], [2, 1]])
t = array([3, 5])
Y = dot(X, R) + t
Z = ???
Nota: Sólo me interesa la forma alineada, ya que el error cuadrado (variabled
en código Matlab) se calcula fácilmente a partir de 2 formas.