LPAD con cero inicial

Tengo mesa con números de factura. Las pautas dicen que los números deben tener 6 o más dígitos. En primer lugar trató de hacer:

UPDATE t1 SET NUMER=CONCAT('00000',NUMER) WHERE LENGTH(NUMER)=1;   
UPDATE t1 SET NUMER=CONCAT('0000',NUMER) WHERE LENGTH(NUMER)=2;  
UPDATE t1 SET NUMER=CONCAT('000',NUMER) WHERE LENGTH(NUMER)=3;  
UPDATE t1 SET NUMER=CONCAT('00',NUMER) WHERE LENGTH(NUMER)=4;  
UPDATE t1 SET NUMER=CONCAT('0',NUMER) WHERE LENGTH(NUMER)=5;  

Pero eso no es eficiente, e incluso bonito. Lo intentéLPAD función, pero luego vino el problema porque la función:

UPDATE t1 SET NUMER=LPAD(NUMER,6,'0') WHERE CHAR_LENGTH(NUMER)<=6 ;

devuelve CERO filas afectadas. También buscó en Google y dicen que poner cero entre comillas resolverá el problema, pero no lo hizo, ¿alguna ayuda? Es una importación diaria.

EDIT: la columna NUMER es INT (19) y contiene datos como:

NUMER
----------
1203  
12303 
123403 
1234503 
...

(está lleno de datos con diferente longitud de 3 a 7 dígitos por ahora)

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