scipy.spatial.distance.pdist Devuelve una matriz de distancia condensada. Desdela documentación:

Devuelve una matriz de distancia condensada Y. Para cada y (donde), la métrica dist (u = X [i], v = X [j]) se calcula y almacena en la entrada ij.

penséij significabai*j. Pero creo que podría estar equivocado. Considerar

X = array([[1,2], [1,2], [3,4]])
dist_matrix = pdist(X)

entonces la documentación dice quedist(X[0], X[2]) debiera serdist_matrix[0*2]. Sin embargo,dist_matrix[0*2] es 0 - no 2.8 como debería ser.

¿Cuál es la fórmula que debo usar para acceder a la similitud de dos vectores, dadoi yj?