So erstellen Sie eine Heatmap mit einem festen externen hierarchischen Cluster

Ich habe Matrixdaten und möchte diese mit einer Heatmap visualisieren. Die Reihen sind Arten, also möchte ich den Stammbaum neben den Reihen visualisieren un...

Färben Sie die Häkchen in einem Dendrogramm so ein, dass sie mit den Clusterfarben übereinstimmen.

Wie kann ich die Beschriftungen eines Dendrogramms individuell einfärben, damit sie mit den Farben der Cluster in MATLAB übereinstimmen? Hier ist ein Beispiel für eine gewünschte Ausgabe, die mit dem Code in meiner Antwort unten generiert wurde ...

Schneiden des Dendrogramms in n Bäume mit einer minimalen Clustergröße in R

Wie berechnet man die Cluster-Entropie? Ein funktionierendes Beispiel oder ein Software-Code [closed]

Ich möchte die Entropie dieses Beispielschemas berechnen http: //nlp.stanford.edu/IR-book/html/htmledition/evaluation-of-clustering-1.htm [http://nlp.stanford.edu/IR-book/html/htmledition/evaluation-of-clustering-1.html] ...

Wie kann man sns.clustermap eine vorberechnete Distanzmatrix geben?

enn ich Dendrogramme und Heatmaps mache, verwende ich normalerweise eine Distanzmatrix und mache eine Reihe vonSciPy Zeug. Ich möchte @ ausprobierSeaborn aberSeaborn möchte meine Daten in rechteckiger Form (Zeilen = Stichproben, Spalten = ...

Verwenden Sie die Distanzmatrix in scipy.cluster.hierarchy.linkage ()?

Ich habe eine Distanzmatrix n * n

spatial clustering in R (einfaches Beispiel)

Ich habe diese einfachedata.frame lat<-c(1,2,3,10,11,12,20,21,22,23) lon<-c(5,6,7,30,31,32,50,51,52,53) data=data.frame(lat,lon)Die Idee ist, die räumlichen Cluster basierend auf der Entfernung zu finden Zunächst zeichne ich die Karte (lon, ...

Textclustering mit Levenshtein-Abständen

Ich habe einen Satz (2k - 4k) kleiner Zeichenfolgen (3-6 Zeichen) und möchte diese gruppieren. Da ich Strings benutze, gehen frühere Antworten aufWie funktioniert das Clustering (insbesondere das ...

Tutorial für scipy.cluster.hierarchy [geschlossen]

Ich versuche zu verstehen, wie man einen Hierarchiecluster manipuliert, aber die Dokumentation ist zu ... technisch? ... und ich kann nicht verstehen, wie es funktioniert. Gibt es ein Tutorial, mit dem ich anfangen kann und das einige einfache ...

Verwenden von iGraph in Python zur Community-Erkennung und Schreiben der Community-Nummer für jeden Knoten in CSV

Ich habe ein Netzwerk, das ich mit dem analysieren möchteedge_betweenness Community-Erkennungsalgorithmus in iGraph. Ich kenne NetworkX, versuche jedoch, iGraph zu lernen, da es über NetworkX zusätzliche Community-Erkennungsmethoden bietet. Mein ...