incremental schreibt mit h5py auf hdf5

Ich habe eine Frage, wie ich mit python / h5py am besten in hdf5-Dateien schreiben kann. Ich habe Daten wie: ----------------------------------------- | timepoint | voltage1 | voltage2 | ... ----------------------------------------- | 178 | 10 ...

Überprüfen Sie, ob der Knoten in h5py vorhanden ist

Schließen Sie eine geöffnete h5py-Datendatei

n unserem Labor speichern wir unsere Daten inhdf5 Dateien durch das Python-Paketh5py. u Beginn eines Experiments erstellen wir einhdf5 file und speichere Array nach Array von Daten in der Datei (unter anderem). Wenn ein Experiment ...

H5py Store Liste der Liste der Zeichenfolgen

Ist in h5py die Möglichkeit vorhanden, einen Datensatz zu erstellen, der aus Listen von Zeichenfolgen besteht. Ich habe versucht, einen verschachtelten Datentyp mit variabler Länge zu erstellen, dies führt jedoch zu einem Segmentierungsfehler in ...

Schreiben eines zusammengesetzten Datensatzes mit einer Zeichenfolge variabler Länge über h5py (HDF5)

Ich konnte in meiner HDF5-Datei mit h5py ein zusammengesetztes Dataset erstellen, das aus einem vorzeichenlosen int und einem String variabler Länge besteht, aber ich kann nicht darauf schreiben. dt = h5py.special_dtype(vlen=str) dset = ...

Von Python erstellter HDF5-Datensatz in Matlab transponiert

Ich habe einige Daten, die ich zwischen Python und Matlab teile. Früher habe ich NumPy-Arrays in MATLAB-ähnlichen .mat-Dateien gespeichert, aber ich wollte zu HDF5-Datasets wechseln. Allerdings ist mir eine lustige Funktion aufgefallen: Wenn ich ...

Lesen Sie ALLE Variablen in einer .mat-Datei mit python h5py

Ich versuche, alle Variablen aus einer '.mat' v7.3-Datei zu ziehen und in NumPy-Arrays umzuwandeln. Gibt es eine Möglichkeit, dies generisch zu tun, wobei vorzugsweise keine Variablennamen angegeben werden müssen? Wie können Sie alle vorhandenen ...

Chain-Datensätze aus mehreren HDF5-Dateien / Datensätzen

Die Vorteile und die vereinfachte Zuordnung, dieh5py bietet (über HDF5) die Möglichkeit, Datenbestände auf der Festplatte beizubehalten. Ich analysiere eine Reihe von Dateien und speichere das Ergebnis in einem Datensatz, einen für jede Datei. Am ...

Schreiben eines großen hdf5-Datensatzes mit h5py

Im Moment benutze ich h5py, um hdf5-Datensätze zu generieren. Ich habe so etwas import h5py import numpy as np my_data=np.genfromtxt("/tmp/data.csv",delimiter=",",dtype=None,names=True) myFile="/tmp/f.hdf" with h5py.File(myFile,"a") as f: dset ...

So überschreiben Sie ein Array in einer h5-Datei mit h5py

Ich versuche, ein numpy Array zu überschreiben, das ein kleiner Teil einer ziemlich komplizierten h5-Datei ist. Ich extrahiere ein Array, ändere einige Werte und möchte das Array erneut in die h5-Datei einfügen. Ich habe kein Problem, das Array ...