Desativar entidade XML resolvendo em JDOM / DOM

Estou escrevendo um aplicativo Java para o pós-processamento de arquivos XML. Esses arquivos xml vêm de uma RDF-Export de um Semantic Mediawiki, portanto, possuem sintaxe rdf / xm

Meu problema é o seguinte: Quando leio o arquivo xml, todas as entidades no arquivo são resolvidas com o valor especificado no Doctype. Por exemplo, no Doctype, tenho

<!DOCTYPE rdf:RDF[
<!ENTITY wiki 'http://example.org/smartgrid/index.php/Special:URIResolver/'>
..
]>

e no elemento raiz

<rdf:RDF
xmlns:wiki="&wiki;"
..
>

Isso signific

<swivt:Subject rdf:about="&wiki;Main_Page">

torna-s

<swivt:Subject rdf:about="http://example.org/smartgrid/index.php/Special:URIResolver/Main_Page">

Tentei usar o JDOM e o DOM Java padrão. O código que acho relevante aqui é para o DOM padrão:

DocumentBuilderFactory factory = DocumentBuilderFactory.newInstance();
        factory.setExpandEntityReferences(false);
        factory.setFeature("http://apache.org/xml/features/nonvalidating/load-external-dtd", false);

e para JDOM

SAXBuilder builder = new SAXBuilder();
    builder.setExpandEntities(false); //Retain Entities
    builder.setValidation(false);
    builder.setFeature("http://xml.org/sax/features/resolve-dtd-uris", false);

Mas as entidades são resolvidas em todo o documento xml. Estou esquecendo de algo? As horas de pesquisa só me levaram aos comandos 'ExpandEntities', mas eles parecem não funcionar.

Qualquer dica é muito apreciada:)

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