Usando um contador dentro de um loop estruturado Apply em R

Estou tentando traçar uma matriz bastante complexa em R. Quero produzir uma imagem com 3 por 3 gráficos, cada um com pontos vermelhos e azuis.

Eu tenho uma estrutura de loops de aplicação que funciona, mas eu gostaria de alterar o valor máximo de y por cada linha.

Eu normalmente faria isso usando um contador, como eu, em outros idiomas. Mas a coisa de aplicar em R está me deixando completamente desconcertada!

par(mfrow=c(3,3),pty="s")             # a 3 by 3 graphic
set.seed(1001)

x <- 1:54                             # with 1 to 54 along the x axis

y <- array(rexp(20), dim=c(54,6,3,2)) # and the y axis coming 
                                      # from an array with dimensions as shown.

ymax <- c(1,0.1,0.3)                  # three different y maximum values I want 
                                      # on the graphic, one for each row of graphs

counter <- 1                          # a counter, starting at 1, 
                                      # as I would use in a traditional loop

apply(y[,3:5,,], 2, function(i)       # my first apply, which only considers
                                      # the 3rd, 4th and 5th columns
    {

    yy <- ymax[counter]               # using the counter to select my ylimit maximum

    apply(i, 2, function (ii)         # my second apply, considering the 3rd 
                                      # dimension of y
        {
            plot(x,ii[,1], col="blue", ylim=c(0,yy)) 

                                      # plotting the 4th dimension

                points(x,ii[,2], col="red") 

                                      # adding points in a different 
                                      # colour from the 4th dim. 

    })
})

Agradecemos antecipadamente por seus pensamentos, eles são muito apreciados!

Cheers Kate

questionAnswers(3)

yourAnswerToTheQuestion