Como configurar o teste para verificação de R CMD?
Existem aparentemente duas maneiras de integrartestthat
comR CMD check
. Eu não posso começar a trabalhar.
De acordo comwiki de devtools:
Ao desenvolver um pacote, coloque seus testes em inst / tests e, em seguida, crie um arquivo tests / run-all.R (note que ele deve ser um R maiúsculo), que contém o seguinte código:
library(testthat)
library(mypackage)
test_package("mypackage")
Isso avaliará seus testes no namespace do pacote (para que você possa testar funções não exportadas) e emitirá um erro se houver falhas no teste. Isso significa que você verá o relatório completo de falhas de teste e a verificação de R CMD não será aprovada, a menos que todos os testes sejam aprovados.
Todo o pacote éAqui. Nela estão os dois arquivos:
## minimalbugexample/inst/tests/run-all.R
library(testthat)
library(minimalbugexample)
test_package('minimalbugexample')
e
## minimalbugexample/inst/tests/test-use-Matrix-package.R
context("Intentional break")
expect_that( TRUE, equals(FALSE))
minha DESCRIÇÃO é
Package: minimalbugexample
Title:
Description:
Version: 0.1.1
Author: Nathan VanHoudnos <[email protected]>
Maintainer: Nathan VanHoudnos <[email protected]>
Depends:
R (>= 3.0.1),
Matrix (>= 1.0)
Suggests:
testthat
License: GPL
LazyData: true
Collate:
'minimalbugexample-package.r'
'use-Matrix-package.R'
Depois de instalar o pacote, posso executar os testes muito bem (eles falham, como esperado).
> test_package('minimalbugexample')
Intentional break : 1
1. Failure: -------------------------------------------------------------------
TRUE not equal to FALSE
1 element mismatch
Error: Test failures
>
Mas umR CMD check
não executa os testes.
$ R CMD check minimalbugexample_0.1.1.tar.gz
... snip ...
* checking PDF version of manual ... WARNING
WARNING: There was 1 warning.
See
‘/home/nathanvan/software/minimalbugexample.Rcheck/00check.log’
for details.
Não acho que o aviso em PDF tenha algo a ver com isso, mas posso fornecer mais detalhes, se solicitado.
Abordagem nº 2: (borda sangrenta)De acordo comArquivo README dotestthat
repositório:
Agora, recomendo praticar é colocar seus testes em testes / testes, e garantir que a verificação do R CMD seja executada, colocando o seguinte código em tests / test-all.R:
library(testthat)
test_check(yourpackage)
Por isso, verifiquei se tinha a versão mais recente do teste instalada:
> install_github("testthat")
E então mudou o pacote. Você pode obter essa versãoAqui. Eu modifiquei os dois arquivos para serem
## minimalbugexample/inst/tests/test-all.R
library(testthat)
test_check(minimalbugexample)
e
## minimalbugexample/inst/tests/testthat/test-use-Matrix-package.R
context("Intentional break")
expect_that( TRUE, equals(FALSE))
Então atualizando a versão do pacote para 0.1.2 no arquivo DESCRIPTION, eu posso construir, instalar e usartestthat
para verificar e obter a mesma saída de antes. Então parece que, tanto quantotestthat
está preocupado, está funcionando.
No entanto, a verificação do R CMD ainda não executa os testes:
$ R CMD check minimalbugexample_0.1.2.tar.gz
... snip ...
* checking PDF version of manual ... WARNING
LaTeX errors when creating PDF version.
This typically indicates Rd problems.
WARNING: There was 1 warning.
See
‘/home/nathanvan/software/minimalbugexample.Rcheck/00check.log’
for details.
Então a questão:O que estou fazendo de errado? Minha preferência é por uma solução para a Abordagem 2, mas vou pegar também!