Как настроить тест для проверки CMD R?
Есть, по-видимому, два способа интеграцииtestthat
с участиемR CMD check
, Я не могу заставить либо работать.
СогласноDevtools Wiki:
При разработке пакета поместите свои тесты в inst / tests, а затем создайте файл tests / run-all.R (обратите внимание, что это должен быть заглавный R), который содержит следующий код:
library(testthat)
library(mypackage)
test_package("mypackage")
Это оценит ваши тесты в пространстве имен пакета (так что вы можете протестировать неэкспортированные функции) и выдаст ошибку, если будут какие-либо тестовые неудачи. Это означает, что вы увидите полный отчет о неудачных тестах, и проверка CMD не пройдет, если не пройдут все тесты.
Весь пакетВот, В нем два файла:
## minimalbugexample/inst/tests/run-all.R
library(testthat)
library(minimalbugexample)
test_package('minimalbugexample')
а также
## minimalbugexample/inst/tests/test-use-Matrix-package.R
context("Intentional break")
expect_that( TRUE, equals(FALSE))
Мое ОПИСАНИЕ
Package: minimalbugexample
Title:
Description:
Version: 0.1.1
Author: Nathan VanHoudnos <[email protected]>
Maintainer: Nathan VanHoudnos <[email protected]>
Depends:
R (>= 3.0.1),
Matrix (>= 1.0)
Suggests:
testthat
License: GPL
LazyData: true
Collate:
'minimalbugexample-package.r'
'use-Matrix-package.R'
После установки пакета я могу нормально запустить тесты (как и ожидалось, они не пройдены).
> test_package('minimalbugexample')
Intentional break : 1
1. Failure: -------------------------------------------------------------------
TRUE not equal to FALSE
1 element mismatch
Error: Test failures
>
НоR CMD check
не запускает тесты.
$ R CMD check minimalbugexample_0.1.1.tar.gz
... snip ...
* checking PDF version of manual ... WARNING
WARNING: There was 1 warning.
See
‘/home/nathanvan/software/minimalbugexample.Rcheck/00check.log’
for details.
Я не думаю, что предупреждение PDF имеет какое-либо отношение к этому, но я могу предоставить более подробную информацию, если потребуется.
Подход № 2: (передовой край)СогласноREADME файлtestthat
хранилище:
Теперь рекомендуем вам поместить ваши тесты в tests / testthat, а затем убедиться, что R CMD check выполняется, поместив следующий код в tests / test-all.R:
library(testthat)
test_check(yourpackage)
Поэтому я убедился, что у меня установлена самая последняя версия теста, которая установлена:
> install_github("testthat")
А потом поменял пакет. Вы можете получить эту версиюВот, Я изменил два файла, чтобы
## minimalbugexample/inst/tests/test-all.R
library(testthat)
test_check(minimalbugexample)
а также
## minimalbugexample/inst/tests/testthat/test-use-Matrix-package.R
context("Intentional break")
expect_that( TRUE, equals(FALSE))
Затем, обновив версию пакета до 0.1.2 в файле DESCRIPTION, я могу собрать его, установить и использоватьtestthat
проверить это и получить тот же вывод, что и раньше. Так что, похоже, насколькоtestthat
обеспокоен тем, что он работает.
Однако проверка CMD по-прежнему не запускает тесты:
$ R CMD check minimalbugexample_0.1.2.tar.gz
... snip ...
* checking PDF version of manual ... WARNING
LaTeX errors when creating PDF version.
This typically indicates Rd problems.
WARNING: There was 1 warning.
See
‘/home/nathanvan/software/minimalbugexample.Rcheck/00check.log’
for details.
Итак, вопрос:Что я делаю неправильно? Я предпочитаю решение для подхода 2, но я возьму и то и другое!