Estou construindo uma grande chamada de banco de dados usandoPreparedStatement que tem mais de 2000 marcadores de parâmetros.

Estou recebendo este erro

Caused by: java.sql.SQLException: Prepared or callable statement has more than 2000 parameter markers.
    at net.sourceforge.jtds.jdbc.SQLParser.parse(SQLParser.java:1139)
    at net.sourceforge.jtds.jdbc.SQLParser.parse(SQLParser.java:156)
    at net.sourceforge.jtds.jdbc.JtdsPreparedStatement.<init>(JtdsPreparedStatement.java:107)
Caused by: java.sql.SQLException: Prepared or callable statement has more than 2000 parameter markers. 

Eu tentei pesquisar os documentos da API e o Google, mas não consegui encontrar como configurar isso.

Alguém sabe se é possível aumentar esse limite? Estou ciente de que vai ser uma chamada de banco de dados lenta, mas isso está bem por enquanto.

Além disso, isso me causará problemas a longo prazo, seria melhor executá-lo em lotes?