Eu tenho uma matriz vaziam:

m <- matrix(0, nrow = 4, ncol = 2, byrow = TRUE,
            dimnames = list(c("sp1", "sp2", "sp3", "sp4"),
                            c("x", "y")))

E precisa preencher a matriz usando o quadro de dados d

d <- data.frame(site = c("x", "y", "u", "v"), 
                species = c("sp1", "sp1", "sp1", "sp1"), 
                freq = c(0.2, 0.3, 0.5, 0.1))

de modo que serowname(m) é igual ad[, "species"] em[, "x"] é igual aod[, "site"] entãod[, "freq"] em entrou no lugar correto na matriz m, ou seja, retornando:

m <- matrix(c(0.2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0), nrow = 4, ncol = 2, byrow = TRUE, 
            dimnames = list(c("sp1", "sp2", "sp3", "sp4"),
                            c("x", "y")))

Eu tentei:

m[d[, c("species", "x")]] <- d[, "freq"]

Eu suspeito que não estou fazendo a indexação de quadros de dados corretamente? Alguma ideia? Obrigado.