Resultados de la búsqueda a petición "hdf5"
ubicaciones de biblioteca compartidas para archivos mex de matlab:
Estoy tratando de escribir una función matlab mex que use libhdf5; Mi instalación de Linux proporciona bibliotecas y encabezados compartidos libhdf5-1.8. Sin embargo, mi versión de Matlab, r2007b, proporciona un libhdf5.so de la versión 1.6. ...
HDF5 rowmajor o colmajor
¿Es posible saber si una matriz almacenada en formato HDF5 está en RowMajor o ColMajor? Por ejemplo, cuando guardo matrices de octava, que las almacena internamente como ColMajor, necesito transponerlas cuando las leo en mi código C, donde las ...
¿Cómo copiar parcialmente usando Python un archivo Hdf5 en uno nuevo manteniendo la misma estructura?
Tengo un gran archivo hdf5 que se parece a esto: A/B/dataset1, dataset2 A/C/dataset1, dataset2 A/D/dataset1, dataset2 A/E/dataset1, dataset2... Quiero crear un nuevo archivo solo con eso: A / B / dataset1, dataset2 A / C / dataset1, ...
escrituras incrementales en hdf5 con h5py
Tengo una pregunta sobre cómo escribir mejor en archivos hdf5 con python / h5py. Tengo datos como: ----------------------------------------- | timepoint | voltage1 | voltage2 | ... ----------------------------------------- | 178 | 10 | 12 | ...
ImportError HDFStore requiere PyTables No hay módulos con nombre en tablas
import pandas as pd dfs = pd.HDFStore('xxxxx.h5')arroja este error: "ImportError: HDFStore requires PyTables, "No module named tables" problem importing" Intenté instalar PyTables, que requiere Cython. Tengo instalado Cython 0.21, pero arroja ...
Error de construcción de C ++ para un código simple usando las bibliotecas armadillo y hdf5
Soy bastante nuevo en C ++ y armadillo, y me quedo atascado con un error de construcción que se describe a continuación. Estoy tratando de probar el siguiente código simple para guardar una matriz de armadillo como archivo hdf5: #include ...
IOError: No se pueden leer los datos (No se puede abrir el directorio) - Falta el filtro de compresión gzip
Nunca antes había trabajado con archivos HDF5 y, para comenzar, recibí algunos archivos de ejemplo. He estado revisando todos los conceptos básicos conh5py, mirando los diferentes grupos en estos archivos, sus nombres, claves, valores, etc. Todo ...
Cerrar un archivo de datos h5py abierto
En nuestro laboratorio almacenamos nuestros datos enhdf5 archivos a través del paquete pythonh5py. Al comienzo de un experimento creamos unhdf5 archivar y almacenar matriz tras matriz de matriz de datos en el archivo (entre otras cosas). Cuando ...
Descubriendo claves usando h5py en python3
Enpython2.7, Puedo analizar unhdf5 uso de claves de archivos $ python >>> import h5py >>> f = h5py.File('example.h5', 'r') >>> f.keys() [u'some_key']Sin embargo, enpython3.4, Obtengo algo diferente: $ python3 -q >>> import h5py >>> f = ...
¿Cuál es la compresión recomendada para HDF5 para un rendimiento de lectura / escritura rápido (en Python / pandas)?
He leído varias veces que activar la compresión en HDF5 puede conducir a un mejor rendimiento de lectura / escritura. Me pregunto qué configuración ideal puede ser para lograr un buen rendimiento de lectura / escritura en: data_df.to_hdf(..., ...