Resultados de la búsqueda a petición "hdf5"

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IOError: No se pueden leer los datos (No se puede abrir el directorio) - Falta el filtro de compresión gzip

Nunca antes había trabajado con archivos HDF5 y, para comenzar, recibí algunos archivos de ejemplo. He estado revisando todos los conceptos básicos conh5py, mirando los diferentes grupos en estos archivos, sus nombres, claves, valores, etc. Todo ...

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Error de construcción de C ++ para un código simple usando las bibliotecas armadillo y hdf5

Soy bastante nuevo en C ++ y armadillo, y me quedo atascado con un error de construcción que se describe a continuación. Estoy tratando de probar el siguiente código simple para guardar una matriz de armadillo como archivo hdf5: #include ...

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ImportError HDFStore requiere PyTables No hay módulos con nombre en tablas

import pandas as pd dfs = pd.HDFStore('xxxxx.h5')arroja este error: "ImportError: HDFStore requires PyTables, "No module named tables" problem importing" Intenté instalar PyTables, que requiere Cython. Tengo instalado Cython 0.21, pero arroja ...

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escrituras incrementales en hdf5 con h5py

Tengo una pregunta sobre cómo escribir mejor en archivos hdf5 con python / h5py. Tengo datos como: ----------------------------------------- | timepoint | voltage1 | voltage2 | ... ----------------------------------------- | 178 | 10 | 12 | ...

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¿Cómo copiar parcialmente usando Python un archivo Hdf5 en uno nuevo manteniendo la misma estructura?

Tengo un gran archivo hdf5 que se parece a esto: A/B/dataset1, dataset2 A/C/dataset1, dataset2 A/D/dataset1, dataset2 A/E/dataset1, dataset2... Quiero crear un nuevo archivo solo con eso: A / B / dataset1, dataset2 A / C / dataset1, ...

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HDF5 rowmajor o colmajor

¿Es posible saber si una matriz almacenada en formato HDF5 está en RowMajor o ColMajor? Por ejemplo, cuando guardo matrices de octava, que las almacena internamente como ColMajor, necesito transponerlas cuando las leo en mi código C, donde las ...

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Conjunto de datos HDF5 creado por Python transpuesto en Matlab

Tengo algunos datos que comparto entre Python y Matlab. Solía hacerlo guardando matrices NumPy en archivos .mat de estilo MATLAB, pero me gustaría cambiar a conjuntos de datos HDF5. Sin embargo, noté una característica divertida: cuando guardo ...

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Libere la memoria de disco hdf5 después de la eliminación de tablas o nodos con pytables o pandas

Estoy usando HDFStore con pandas / pytables.Después de eliminar una tabla u objeto, el tamaño del archivo hdf5 no se ve afectado. Parece que este espacio se ...

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Anexando la columna al marco del archivo HDF en Pandas

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Mejora el rendimiento de escritura de la tabla HDF5 de pandas (¿PyTables?)

He estado usando pandas para investigación ahora por cerca de dos meses con gran efecto. Con un gran número de conjuntos de datos de eventos de seguimiento d...