Resultados de la búsqueda a petición "h5py"
lea el archivo matlab v7.3 en la lista de python de matrices numpy a través de h5py
Sé que esto se ha preguntado antes, pero en mi opinión todavía no hay respuestas que expliquen qué está sucediendo y que no funcionan para mi caso. Tengo un archivo matlab v7. 3 que está estructurado así, ---> rank <1x454 cell> ---> each element ...
Lectura de TODAS las variables en un archivo .mat con python h5py
Estoy tratando de extraer todas las variables de un archivo '.mat' v7.3 y convertirlas en matrices NumPy. ¿Hay alguna manera de hacer esto genéricamente, preferiblemente sin necesidad de especificar nombres de variables? ¿Cómo puede obtener todos ...
Cerrar un archivo de datos h5py abierto
En nuestro laboratorio almacenamos nuestros datos enhdf5 archivos a través del paquete pythonh5py. Al comienzo de un experimento creamos unhdf5 archivar y almacenar matriz tras matriz de matriz de datos en el archivo (entre otras cosas). Cuando ...
¿Cómo atravesar un archivo hdf5 usando h5py
¿Cómo recorro todos los grupos y conjuntos de datos de un archivo hdf5 usando h5py? Quiero recuperar todo el contenido del archivo desde una raíz común usando un bucle for o algo similar.
Archivos corruptos al crear archivos HDF5 sin cerrarlos (h5py)
Estoy usando h5py para almacenar datos de experimentos en un contenedor HDF5. En una sesión interactiva abro el archivo usando: measurement_data = h5py.File('example.hdf5', 'a')Luego escribo datos en el archivo usando algunas funciones ...
¿Cuál es la compresión recomendada para HDF5 para un rendimiento de lectura / escritura rápido (en Python / pandas)?
He leído varias veces que activar la compresión en HDF5 puede conducir a un mejor rendimiento de lectura / escritura. Me pregunto qué configuración ideal puede ser para lograr un buen rendimiento de lectura / escritura en: data_df.to_hdf(..., ...
fuera del núcleo de almacenamiento de imágenes 4D tif como hdf5 python
Tengo 27 GB de archivos tiff 2D que representan segmentos de una película de imágenes 3D. Quiero poder dividir estos datos como si fuera una simple matriz numpy4d. Parece que dask.array es una buena herramienta para manipular limpiamente la ...
Escribir en un conjunto de datos compuesto con una cadena de longitud variable a través de h5py (HDF5)
He podido crear un conjunto de datos compuesto que consiste en un int sin signo y una cadena de longitud variable en mi archivo HDF5 usando h5py, pero no puedo escribir en él. dt = h5py.special_dtype(vlen=str) dset = fout.create_dataset(ver, ...
¿Cómo diferenciar entre conjuntos de datos HDF5 y grupos con h5py?
Uso el paquete Python h5py (versión 2.5.0) para acceder a mis archivos hdf5. Quiero atravesar el contenido de un archivo y hacer algo con cada conjunto de datos. Utilizando lavisit método: import h5py def print_it(name): dset = f[name] ...
Escribir un gran conjunto de datos hdf5 usando h5py
Por el momento, estoy usando h5py para generar conjuntos de datos hdf5. Tengo algo como esto import h5py import numpy as np my_data=np.genfromtxt("/tmp/data.csv",delimiter=",",dtype=None,names=True) myFile="/tmp/f.hdf" with h5py.File(myFile,"a") ...