Resultados de la búsqueda a petición "h5py"
Escribir en un conjunto de datos compuesto con una cadena de longitud variable a través de h5py (HDF5)
He podido crear un conjunto de datos compuesto que consiste en un int sin signo y una cadena de longitud variable en mi archivo HDF5 usando h5py, pero no puedo escribir en él. dt = h5py.special_dtype(vlen=str) dset = fout.create_dataset(ver, ...
fuera del núcleo de almacenamiento de imágenes 4D tif como hdf5 python
Tengo 27 GB de archivos tiff 2D que representan segmentos de una película de imágenes 3D. Quiero poder dividir estos datos como si fuera una simple matriz numpy4d. Parece que dask.array es una buena herramienta para manipular limpiamente la ...
¿Cuál es la compresión recomendada para HDF5 para un rendimiento de lectura / escritura rápido (en Python / pandas)?
He leído varias veces que activar la compresión en HDF5 puede conducir a un mejor rendimiento de lectura / escritura. Me pregunto qué configuración ideal puede ser para lograr un buen rendimiento de lectura / escritura en: data_df.to_hdf(..., ...
Archivos corruptos al crear archivos HDF5 sin cerrarlos (h5py)
Estoy usando h5py para almacenar datos de experimentos en un contenedor HDF5. En una sesión interactiva abro el archivo usando: measurement_data = h5py.File('example.hdf5', 'a')Luego escribo datos en el archivo usando algunas funciones ...
¿Cómo atravesar un archivo hdf5 usando h5py
¿Cómo recorro todos los grupos y conjuntos de datos de un archivo hdf5 usando h5py? Quiero recuperar todo el contenido del archivo desde una raíz común usando un bucle for o algo similar.
Cerrar un archivo de datos h5py abierto
En nuestro laboratorio almacenamos nuestros datos enhdf5 archivos a través del paquete pythonh5py. Al comienzo de un experimento creamos unhdf5 archivar y almacenar matriz tras matriz de matriz de datos en el archivo (entre otras cosas). Cuando ...
Lectura de TODAS las variables en un archivo .mat con python h5py
Estoy tratando de extraer todas las variables de un archivo '.mat' v7.3 y convertirlas en matrices NumPy. ¿Hay alguna manera de hacer esto genéricamente, preferiblemente sin necesidad de especificar nombres de variables? ¿Cómo puede obtener todos ...
lea el archivo matlab v7.3 en la lista de python de matrices numpy a través de h5py
Sé que esto se ha preguntado antes, pero en mi opinión todavía no hay respuestas que expliquen qué está sucediendo y que no funcionan para mi caso. Tengo un archivo matlab v7. 3 que está estructurado así, ---> rank <1x454 cell> ---> each element ...
IOError: No se pueden leer los datos (No se puede abrir el directorio) - Falta el filtro de compresión gzip
Nunca antes había trabajado con archivos HDF5 y, para comenzar, recibí algunos archivos de ejemplo. He estado revisando todos los conceptos básicos conh5py, mirando los diferentes grupos en estos archivos, sus nombres, claves, valores, etc. Todo ...
escrituras incrementales en hdf5 con h5py
Tengo una pregunta sobre cómo escribir mejor en archivos hdf5 con python / h5py. Tengo datos como: ----------------------------------------- | timepoint | voltage1 | voltage2 | ... ----------------------------------------- | 178 | 10 | 12 | ...