He estado probando la nueva característica de minificación y agrupación en ASP.NET MVC 4, y funciona muy bien siempre que use las convenciones de carpeta predeterminadas para archivos css y js.

/Content
/Scripts

Normalmente pongo css y script en una carpeta llamada Estática como esta

/Static/Css
/Static/Js

Intenté registrar mis propios paquetes de esta manera:

public static class BundleCollectionExtensions
{
    public static void RegisterScriptsAndCss(this BundleCollection bundles)
    {
        var bootstrapCss = new Bundle("~/Static/Css", new CssMinify());
        bootstrapCss.AddDirectory("~/Static/Css", "*.css");
        bootstrapCss.AddFile("~/Static/Css/MvcValidation.css");
        bootstrapCss.AddFile("~/Static/Css/bootstrap-responsive.min.css");
        bootstrapCss.AddFile("~/Static/Css/bootstrap.min.css");

        bundles.Add(bootstrapCss);

        var bootstrapJs = new Bundle("~/Static/Js", new JsMinify());
        bootstrapJs.AddDirectory("~/Static/Js", "*.js");
        bootstrapJs.AddFile("~/Static/Js/jquery-1.7.1.min.js");
        bootstrapJs.AddFile("~/Static/Js/jquery.validate.min.js");
        bootstrapJs.AddFile("~/Static/Js/jquery.validate.unobtrusive.min.js");
        bootstrapJs.AddFile("~/Static/Js/bootstrap.min.js");
        bootstrapJs.AddFile("~/Static/Js/gunsforhire.js");

        bundles.Add(bootstrapJs);
    }
}

Y e

Global.ascx.cs

Hice esto

BundleTable.Bundles.RegisterScriptsAndCss();

El marcado generado se ve así:

<link href="/Static/Css?v=D9JdmLZFFwjRwraNKfA1uei_YMoBoqLf-gFc0zHivM41" rel="stylesheet" type="text/css" />

<script src="/Static/Js?v=mbKbf5__802kj-2LS5j9Ba-wvSxBCKNMQGBgzou6iZs1" type="text/javascript"></script>

Sin embargo, no funciona, la solicitud se ve así:

Request URL:http://localhost:49603/Static/Js?v=mbKbf5__802kj-2LS5j9Ba-wvSxBCKNMQGBgzou6iZs1
Request Method:GET
Status Code:301 Moved Permanently (from cache)
Query String Parametersview URL encoded
v:mbKbf5__802kj-2LS5j9Ba-wvSxBCKNMQGBgzou6iZs1

Request URL:http://localhost:49603/Static/Js/?v=mbKbf5__802kj-2LS5j9Ba-wvSxBCKNMQGBgzou6iZs1
Request Method:GET
Status Code:404 Not Found
Request Headersview source
Accept:*/*
Accept-Charset:ISO-8859-1,utf-8;q=0.7,*;q=0.3
Accept-Encoding:gzip,deflate,sdch
Accept-Language:en-US,en;q=0.8
Connection:keep-alive
Host:localhost:49603
Referer:http://localhost:49603/
User-Agent:Mozilla/5.0 (Windows NT 6.1; WOW64) AppleWebKit/535.11 (KHTML, like Gecko)        Chrome/17.0.963.56 Safari/535.11
Query String Parametersview URL encoded
v:mbKbf5__802kj-2LS5j9Ba-wvSxBCKNMQGBgzou6iZs1
Response Headersview source
Cache-Control:private
Content-Length:4757
Content-Type:text/html; charset=utf-8
Date:Thu, 01 Mar 2012 19:05:44 GMT
Server:Microsoft-IIS/7.5
X-Powered-By:ASP.NET
X-SourceFiles:=?UTF-8?B?   QzpcQENvZGVccGVsbGVccGVsbGVoZW5yaWtzc29uLnNlXHNyY1xXZWJcU3RhdGljXEpzXA==?=

¿Qué estoy haciendo mal

Actualiza

Creo que finalmente pude resolver esto haciendo lo siguiente:

Eliminar las llamadas de AddDirectorybootstrapCss.AddDirectory("~/Static/Css", "*.css");

Dar las rutas de los paquetes que no reflejan la estructura real del directorio