¿Cómo establecer un elemento único de la matriz Numpy multidimensional utilizando otra matriz Numpy?

Si tenemos una matriz numpy como:

Array = np.zeros((2, 10, 10))

y queremos establecer un elemento del mismo, dado por otro

indexes = np.array([0,0,0])

¿Cómo podemos hacer eso?

Array[indexes] = 5 

está configurando cada elemento de la PRIMERA dimensión de Array en 5

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