Estoy tratando de entender cómo R determina los grupos de referencia para las interacciones en un modelo lineal. Considera lo siguiente:

df <- structure(list(id = structure(c(1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 2L, 2L, 
2L, 2L, 2L, 2L, 3L, 3L, 3L, 3L, 3L, 3L, 4L, 4L, 4L, 4L, 4L, 4L, 
5L, 5L, 5L, 5L, 5L, 5L), .Label = c("1", "2", "3", "4", "5"), class = "factor"), 
    year = structure(c(1L, 2L, 1L, 2L, 1L, 2L, 1L, 2L, 1L, 2L, 
    1L, 2L, 1L, 2L, 1L, 2L, 1L, 2L, 1L, 2L, 1L, 2L, 1L, 2L, 1L, 
    2L, 1L, 2L, 1L, 2L), .Label = c("1", "2"), class = "factor"), 
    treatment = structure(c(2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 1L, 1L, 1L, 
    1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 
    2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L), .Label = c("0", "1"), class = "factor"), 
    y = c(1.4068142116718, 2.67041187927052, 2.69166439169131, 
    3.56550324537293, 1.60021286173782, 4.26629963353237, 3.85741108250572, 
    5.15740731957689, 4.15629768365669, 6.14875441068499, 3.31277276551286, 
    3.47223277168367, 3.74152201649338, 4.02734382610191, 4.49388620764795, 
    5.6432833241724, 4.76639399631094, 4.16885857079297, 4.96830394378801, 
    5.6286092105837, 6.60521404151111, 5.51371821706176, 3.97244221149279, 
    5.68793413111161, 4.90457233598412, 6.02826151378941, 4.92468415350312, 
    8.23718422822134, 5.87695836962708, 7.47264895892575)), .Names = c("id", 
"year", "treatment", "y"), row.names = c(NA, -30L), class = "data.frame")


lm(y ~ -1 + id + year + year:treatment, df)

#Coefficients:
#             id1               id2               id3               id4  
#          2.6585            3.9933            4.1161            5.3544  
#             id5             year2  year1:treatment1  year2:treatment1  
#          6.1991            0.7149           -0.6317                NA  

R intenta estimar el conjunto completo de interacciones en lugar de omitir constantemente un grupo de referencia. Como resultado, estoy obteniendoNAEstá en los resultados.

Además, R es inconsistente con qué grupos cae. Me gustaría estimar un modelo con el mismo grupo omitido (year1) en el efecto principal y las interacciones. Cómo forzar a R a omitiryear1 yyear1:treatment1 del modelo anterior?

Entiendo que hay varias soluciones para este problema (por ejemplo, crear todas las variables a mano y escribirlas en la fórmula del modelo). Pero los modelos reales que estoy estimando son versiones mucho más complicadas de este problema y tal solución sería engorrosa.