Estoy tratando de cambiar el orden en que aparecen los elementos de la leyenda. He pasado alrededor de una hora en esto, sin resultados.

Aquí hay un ejemplo de configuración:

library(ggplot2)
set.seed(0)
d <- data.frame(x = runif(3), y = runif(3), a = c('1', '3', '10'))

Y aquí está una de las muchas cosas que he probado:

ggplot(d, aes(x = x, y = y)) + 
    geom_point(size=7, aes(color = a, order = as.numeric(a)))

(Mi ingenua esperanza, por supuesto, era que los elementos de la leyenda se mostraran en el orden numérico: 1, 3, 10.)