He configurado codeigniter para cargar archivos pequeños <2MB y eso funciona bien. Pero tengo problemas para subir archivos grandes 20MB>

   function stage1()
    {
    ini_set('upload_max_filesize', '200M');
    ini_set('post_max_size', '200M');                               
    ini_set('max_input_time', 3000);                                
    ini_set('max_execution_time', 3000);

    $config['upload_path'] = './temp/';
    $config['allowed_types'] = 'zip';

    $this->load->library('upload', $config);
    $this->upload->initialize($config);                             
    if(!$this->upload->do_upload('userfile'))                       
    {
      $error = array('error' => $this->upload->display_errors());   
      $this->load->view('upload_form', $error);                     
    }
    else
    {
      $data = array('upload_data' => $this->upload->data());        
      //do stuff
    }
  } 

No estoy seguro de lo que está mal con el código anterior. Anulé el php.ini para aceptar archivos más grandes y para tomarme más tiempo ejecutando el script, pero sigue devolviendo el mismo error:

You did not select a file to upload.

De nuevo, esto funciona con archivos pequeños pero no con archivos grandes.

EDITAR: Resulta que mi proveedor de servidor tiene cargas limitadas de archivos, por lo que no hay otra solución que FTP en el archivo.