Esta pregunta fue motivada porRmarkdown no genera resultados del comando del sistema en el archivo html. Por alguna razón, la salida desystem() en R (osystem2()) no puede ser capturado porsink() ocapture.output()así que actualmente no hay forma detejedor para grabar la salida. Por ejemplo, en la consola R:

> system('ls')
DESCRIPTION
NAMESPACE
R
README.md
inst
man

pero en untejedor documento, no verá el resultado, porquecapture.output(system('ls')) escharacter(0), es decir, la salida no se puede capturar. Por supuesto que puedo hacercat(system('ls', intern = TRUE), sep = '\n') como mencioné en la respuesta a esa pregunta, pero esto es un poco incómodo. Me pregunto si es una forma de capturar la salida desystem() sin usointern = TRUE ycat().

Actualizar: verhttps://github.com/yihui/knitr/issues/1203 por un truco que proporcioné para resolver el problema.