Recientemente actualicé mi aplicación de iOS 8.3 a iOS 9. Después de corregir los diversos errores con el código, logré compilar la aplicación y ejecutarla, cuando noté el siguiente problema.

Cuando realizo un clic segue, por ejemplo, un botón UIB, la vista cargada con el segue aparece con la animación de una vista modal (deslizándose desde la parte inferior hasta llegar a la parte superior), pero en el guión gráfico el segue esShow (e.g. Push). Además, el botón Atrás del controlador de navegación ya no aparece.

La consola imprime esto cuando realizo un segue:

Attempting to load the view of a view controller while it is deallocating is not allowed and may result in undefined behavior (<UISearchController: 0x7ffde14866b0>)

El problema parece estar presente solo en una vista, al cargar otras vistas, traté de establecer otras vistas como Controlador de vista inicial y todo funciona.