Puedo ejecutar con éxito un script de Python que usa

from sklearn.cluster import DBSCAN

desde el indicador de terminal cygwin de 64 bits que utiliza una compilación de 64 bits de python 2.7.

Cuando ejecuto lo mismo desde pycharm de 64 bits y de 32 bits con-vv opciones de intérprete, obtengo (las primeras 2 líneas son la salida detallada):

import numpy.linalg.linalg # precompiled from /usr/lib/python2.7/site-packages/numpy/linalg/linalg.pyc
dlopen("/usr/lib/python2.7/site-packages/numpy/linalg/lapack_lite.dll", 2);
Traceback (most recent call last):
  File "C:/Users/mack0242/Dropbox/PhD/scripts/cluster.py", line 5, in <module>
    from sklearn.cluster import DBSCAN
  File "/usr/lib/python2.7/site-packages/sklearn/__init__.py", line 57, in <module>
    from .base import clone
  File "/usr/lib/python2.7/site-packages/sklearn/base.py", line 9, in <module>
    import numpy as np
  File "/usr/lib/python2.7/site-packages/numpy/__init__.py", line 170, in <module>
    from . import add_newdocs
  File "/usr/lib/python2.7/site-packages/numpy/add_newdocs.py", line 13, in <module>
    from numpy.lib import add_newdoc
  File "/usr/lib/python2.7/site-packages/numpy/lib/__init__.py", line 18, in <module>
    from .polynomial import *
  File "/usr/lib/python2.7/site-packages/numpy/lib/polynomial.py", line 19, in <module>
    from numpy.linalg import eigvals, lstsq, inv
  File "/usr/lib/python2.7/site-packages/numpy/linalg/__init__.py", line 51, in <module>
    from .linalg import *
  File "/usr/lib/python2.7/site-packages/numpy/linalg/linalg.py", line 29, in <module>
    from numpy.linalg import lapack_lite, _umath_linalg
ImportError: No such file or directory

Lo he verificado dos veces y el archivo:

/usr/lib/python2.7/site-packages/numpy/linalg/lapack_lite.dll

existe y es de 64 bits. He instalado con éxito numpy, scipy y sklearn desde pip en el terminal cygwin.

Además, PyCharm dice que no hay módulos nombradossklearn, matplotlib ynumpy.