La aplicación web no publicará sin archivos .cs

Tengo un proyecto de aplicación web asp.net que estoy publicando a través de Build> Publish en Visual Studio 2013. Estoy publicando en el sistema de archivos, usando la opción de precompilación seleccionada. Mi proyecto tiene "Solo archivos necesarios para ejecutar esta aplicación" seleccionado en la pantalla de configuración Paquete / Publicar Web. Sin embargo, independientemente de lo que haga, los archivos .cs (código subyacente) y los archivos designer.cs se copian en la carpeta de salida durante la publicación.

Este proyecto se creó utilizando la funcionalidad Archivo> Nuevo proyecto> Aplicación web ASP.NET en Visual Studio. Luego, los archivos de un proyecto de sitio web se agregaron a la aplicación, y el comando "convertir a aplicación web" se ejecutó desde el menú de compilación. La conversión a una aplicación web parece haber funcionado bien, pero no puedo publicar sin incluir los archivos .cs.

¿Qué más se debe hacer para que una aplicación web se publique sin incluir los archivos de código subyacente? ¿Alguna idea sobre lo que puedo investigar?

¿Podría haber una configuración en el nivel de solución que esté causando esto? La nueva aplicación web se agregó a una solución preexistente con aproximadamente una docena de otros proyectos.

Otra cosa a tener en cuenta es que cuando creo una nueva aplicación web con Visual Studio en un nuevo proyecto y publico con la misma configuración, NO incluye los archivos .cs.

También intenté eliminar y luego crear un nuevo perfil de publicación.

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