Si la página tiene archivos .pdf vinculados, entonces un mensaje en<p> Debe agregarse justo antes del final de la#mainontent div como último párrafo<p>

por ejemplo, este es el html predeterminado?

<div id="maincontent">
<ul class="cheat_sheet_downloads">
<li><a href="http://www.addedbytes.com/download/css-cheat-sheet-v2.pdf">PDF, 316Kb</a></li>
<li><a href="http://www.addedbytes.com/download/css-cheat-sheet-v3.pdf/">PNG, 77Kb</a></li>
</ul>
<div>

Despues de detectar pdf

debería ser así

<div id="maincontent">
    <ul class="cheat_sheet_downloads">
    <li><a href="http://www.addedbytes.com/download/css-cheat-sheet-v2.pdf/">PDF, 316Kb</a></li>
    <li><a href="http://www.addedbytes.com/download/css-cheat-sheet-v3.pdf/">PNG, 77Kb</a></li>
    </ul>
<div>

<div id="ttip">
Most computers will open PDF documents automatically, but you may need to 
download <a title="Link to Adobe website - opens in a new window"  
href="http://www.adobe.com/products/acrobat/readstep2.html" target="_blank">
                 Adobe Reader</a>.
</div>

o como otro div después#maincontent div. ¿Es posible con jQuery?

Editar:

La página puede tener uno o más PDF. Quiero agregar un mensaje en la parte inferior. y necesito compatibilidad con IE 6 también

Edición 2: no puedo y no quiero usar el cursor sobre la información sobre herramientas