La advertencia de read.csv 'EOF dentro de la cadena entre comillas' impide la lectura completa del archivo
yo tengoun archivo CSV (24.1 MB) que no puedo leer completamente en mi sesión de R. Cuando abro el archivo en un programa de hoja de cálculo puedo ver 112,544 filas. Cuando lo leí en R conread.csv Solo obtengo 56,952 filas y esta advertencia:
cit <- read.csv("citations.CSV", row.names = NULL,
comment.char = "", header = TRUE,
stringsAsFactors = FALSE,
colClasses= "character", encoding= "utf-8")
Warning message:
In scan(file, what, nmax, sep, dec, quote, skip, nlines, na.strings, :
EOF within quoted string
Puedo leer todo el archivo en R conreadLines:
rl <- readLines(file("citations.CSV", encoding = "utf-8"))
length(rl)
[1] 112545
Pero no puedo devolver esto a R como una tabla (a través deread.csv):
write.table(rl, "rl.txt", quote = FALSE, row.names = FALSE)
rl_in <- read.csv("rl.txt", skip = 1, row.names = NULL)
Warning message:
In scan(file, what, nmax, sep, dec, quote, skip, nlines, na.strings, :
EOF within quoted string
¿Cómo puedo resolver o solucionar este mensaje EOF (que parece ser más un error que una advertencia) para obtener el archivo completo en miR ¿sesión?
Tengo problemas similares con otros métodos de lectura de archivos CSV:
require(sqldf)
cit_sql <- read.csv.sql("citations.CSV", sql = "select * from file")
require(data.table)
cit_dt <- fread("citations.CSV")
require(ff)
cit_ff <- read.csv.ffdf(file="citations.CSV")
Aquí está mi sessionInfo ()
R version 3.0.1 (2013-05-16)
Platform: x86_64-w64-mingw32/x64 (64-bit)
locale:
[1] LC_COLLATE=English_United States.1252 LC_CTYPE=English_United States.1252
[3] LC_MONETARY=English_United States.1252 LC_NUMERIC=C
[5] LC_TIME=English_United States.1252
attached base packages:
[1] tools tcltk stats graphics grDevices utils datasets methods base
other attached packages:
[1] ff_2.2-11 bit_1.1-10 data.table_1.8.8 sqldf_0.4-6.4
[5] RSQLite.extfuns_0.0.1 RSQLite_0.11.4 chron_2.3-43 gsubfn_0.6-5
[9] proto_0.3-10 DBI_0.2-7