Últimamente me he encontrado con este problema ... Al depurar una aplicación en VS.Net 2005, los puntos de interrupción no están conectados. El error indica que el código compilado no es el mismo que el de la versión en ejecución y, por lo tanto, hay una discrepancia que hace que el punto de interrupción se desconecte.

La solución limpia de todos los archivos bin y la compilación no ayuda. No solo sucede en una sola caja o persona tampoco.

Nota agregada: Esta solución está en TFS para Source Control. Si elimino mi repositorio local de TFS y lo obtengo del control de origen desde cero, A VECES, el problema desaparece. También he intentado desinstalar y volver a instalar Visual Studio. Eso también ayuda a ALGUNAS VECES. El hecho de que ambos trabajen parte del tiempo indica que el problema no es causado directamente por ninguno de los dos.