Protocolo personalizado en Linux?

Estoy intentando portar uno de mis proyectos de hobby a Linux. Preferiblemente a Mono ya que está escrito en C #. Pero también estoy investigando Python. Una de las características de la aplicación es que necesita asociarse con un protocolo ...

Implementando el protocolo de comunicación en Java utilizando el diseño de patrones de estado.

Programación de esquemas @URL (controlador de protocolo) para Windows?

Esta págin [http://www.xmldatabases.org/WK/blog/1154%5FHandling%5FURL%5Fschemes%5Fin%5FCocoa.item] explica cómo hacer una aplicación Mac para manejar esquemas de URL personalizados. ¿Cómo puedo hacer lo mismo con la PC?