Sé que esto se puede lograr con otros paquetes, pero estoy tratando de hacerlo endata.table (ya que parece ser el más rápido para agrupar).

library(data.table)
dt = data.table(a=c(1,2,2,3))
dt[,length(a),by=a]

resultados en

   a V1
1: 1  1
2: 2  1
3: 3  1

mientras

df = data.frame(a=c(1,2,2,3))
ddply(df,.(a),summarise,V1=length(a))

produce

  a V1
1 1  1
2 2  2
3 3  1

Que es un resultado más sensible. Solo preguntandome porquedata.table No está dando los mismos resultados, y cómo se puede lograr esto.