Suchergebnisse für Anfrage "hierarchical-clustering"

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Wie kann man sns.clustermap eine vorberechnete Distanzmatrix geben?

enn ich Dendrogramme und Heatmaps mache, verwende ich normalerweise eine Distanzmatrix und mache eine Reihe vonSciPy Zeug. Ich möchte @ ausprobierSeaborn aberSeaborn möchte meine Daten in rechteckiger Form (Zeilen = Stichproben, Spalten = ...

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Wie berechnet man die Cluster-Entropie? Ein funktionierendes Beispiel oder ein Software-Code [closed]

Ich möchte die Entropie dieses Beispielschemas berechnen http: //nlp.stanford.edu/IR-book/html/htmledition/evaluation-of-clustering-1.htm [http://nlp.stanford.edu/IR-book/html/htmledition/evaluation-of-clustering-1.html] ...

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Färben Sie die Häkchen in einem Dendrogramm so ein, dass sie mit den Clusterfarben übereinstimmen.

Wie kann ich die Beschriftungen eines Dendrogramms individuell einfärben, damit sie mit den Farben der Cluster in MATLAB übereinstimmen? Hier ist ein Beispiel für eine gewünschte Ausgabe, die mit dem Code in meiner Antwort unten generiert wurde ...

TOP-Veröffentlichungen

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Große Distanzmatrix im Clustering

Ich führe R 3.2.3 auf einem Computer mit 16 GB RAM aus. Ich habe eine große Matrix von 3.00.000 Zeilen x 12 Spalten. Ich möchte einen hierarchischen Clustering-Algorithmus in R verwenden. Bevor ich das tue, versuche ich, eine Distanzmatrix zu ...

6 die antwort

Verwenden Sie R, um basierend auf dem euklidischen Abstand und einer vollständigen Verknüpfungsmetrik zu viele Vektoren zu gruppieren?

Ich versuche herauszufinden, wie man eine Zählmatrix in R einliest und dann basierend auf dem euklidischen Abstand und einer vollständigen Verbindungsmetrik gruppiert. Die ursprüngliche Matrix hat 56.000 Zeilen (Gene) und 7 ...

6 die antwort

spatial clustering in R (einfaches Beispiel)

Ich habe diese einfachedata.frame lat<-c(1,2,3,10,11,12,20,21,22,23) lon<-c(5,6,7,30,31,32,50,51,52,53) data=data.frame(lat,lon)Die Idee ist, die räumlichen Cluster basierend auf der Entfernung zu finden Zunächst zeichne ich die Karte (lon, ...

1 die antwort

Verwenden von iGraph in Python zur Community-Erkennung und Schreiben der Community-Nummer für jeden Knoten in CSV

Ich habe ein Netzwerk, das ich mit dem analysieren möchteedge_betweenness Community-Erkennungsalgorithmus in iGraph. Ich kenne NetworkX, versuche jedoch, iGraph zu lernen, da es über NetworkX zusätzliche Community-Erkennungsmethoden bietet. Mein ...

1 die antwort

So erhalten Sie Nicht-Singleton-Cluster-IDs in scipy hierachical clustering

Gemäßdiese [http://docs.scipy.org/doc/scipy/reference/generated/scipy.cluster.hierarchy.dendrogram.html#scipy.cluster.hierarchy.dendrogram] Wir können Labels für Nicht-Singleton-Cluster erhalten. Ich habe es mit einem einfachen Beispiel ...

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Färben Sie Zweige des Dendrogramms anhand einer vorhandenen Spalte

Ich habe einen Datenrahmen, den ich zu gruppieren versuche. ich benutzehclust jetzt sofort. In meinem Datenrahmen gibt es eineFLAG Spalte, mit der ich das Dendrogramm ausmalen möchte. Durch das resultierende Bild versuche ich, Ähnlichkeiten ...

1 die antwort

Tutorial für scipy.cluster.hierarchy [geschlossen]

Ich versuche zu verstehen, wie man einen Hierarchiecluster manipuliert, aber die Dokumentation ist zu ... technisch? ... und ich kann nicht verstehen, wie es funktioniert. Gibt es ein Tutorial, mit dem ich anfangen kann und das einige einfache ...