Suchergebnisse für Anfrage "h5py"
H5py Store Liste der Liste der Zeichenfolgen
Ist in h5py die Möglichkeit vorhanden, einen Datensatz zu erstellen, der aus Listen von Zeichenfolgen besteht. Ich habe versucht, einen verschachtelten Datentyp mit variabler Länge zu erstellen, dies führt jedoch zu einem Segmentierungsfehler in ...
Speichern mit h5py-Arrays unterschiedlicher Größe
Ich versuche, etwa 3000 Numpy-Arrays im HDF5-Datenformat zu speichern. Arrays variieren in der Länge von 5306 bis 121999 np.float64 Ich bekommeObject dtype dtype('O') has no native HDF5 equivalent Fehler, da aufgrund der Unregelmäßigkeit der ...
Chain-Datensätze aus mehreren HDF5-Dateien / Datensätzen
Die Vorteile und die vereinfachte Zuordnung, dieh5py bietet (über HDF5) die Möglichkeit, Datenbestände auf der Festplatte beizubehalten. Ich analysiere eine Reihe von Dateien und speichere das Ergebnis in einem Datensatz, einen für jede Datei. Am ...
Visible Deprecation warning…?
Ich habe einige Daten, die ich aus einer h5-Datei als Numpy-Array lese und mit denen ich einige Analysen mache. Für den Kontext zeichnen die Daten eine spektrale Antwortkurve auf. Ich indiziere die Daten (und ein nachfolgendes Array, das ich für ...
Schreiben eines großen hdf5-Datensatzes mit h5py
Im Moment benutze ich h5py, um hdf5-Datensätze zu generieren. Ich habe so etwas import h5py import numpy as np my_data=np.genfromtxt("/tmp/data.csv",delimiter=",",dtype=None,names=True) myFile="/tmp/f.hdf" with h5py.File(myFile,"a") as f: dset ...
Wie kann man mit h5py zwischen HDF5-Datensätzen und -Gruppen unterscheiden?
Ich benutze das Python-Paket h5py (Version 2.5.0), um auf meine hdf5-Dateien zuzugreifen. Ich möchte den Inhalt einer Datei durchlaufen und mit jedem Datensatz etwas anfangen. Verwendung dervisit Methode import h5py def print_it(name): dset = ...
Schreiben eines zusammengesetzten Datensatzes mit einer Zeichenfolge variabler Länge über h5py (HDF5)
Ich konnte in meiner HDF5-Datei mit h5py ein zusammengesetztes Dataset erstellen, das aus einem vorzeichenlosen int und einem String variabler Länge besteht, aber ich kann nicht darauf schreiben. dt = h5py.special_dtype(vlen=str) dset = ...
out of core 4D image tif speicher als hdf5 python
Ich habe 27 GB 2D-Tiff-Dateien, die Teile eines Films mit 3D-Bildern darstellen. Ich möchte in der Lage sein, diese Daten aufzuteilen, als ob es ein einfaches numpy4d-Array wäre. Es sieht so aus, als ob dask.array ein gutes Werkzeug ist, um das ...
Was ist die empfohlene Komprimierung für HDF5 für eine schnelle Lese- / Schreibleistung (in Python / Pandas)?
Ich habe mehrmals gelesen, dass das Aktivieren der Komprimierung in HDF5 zu einer besseren Lese- / Schreibleistung führen kann. Ich frage mich, welche idealen Einstellungen für eine gute Lese- / Schreibleistung geeignet ...
Korrupte Dateien beim Erstellen von HDF5-Dateien, ohne sie zu schließen (h5py)
Ich verwende h5py, um Experimentdaten in einem HDF5-Container zu speichern. In einer interaktiven Sitzung öffne ich die Datei mit: measurement_data = h5py.File('example.hdf5', 'a')Dann schreibe ich Daten mithilfe einiger selbst geschriebener ...