Я ранее спрашивал окоманды для преобразования R Markdown в HTML.

What is a good way to convert R Markdown files to PDF documents?

Хорошее решение позволит сохранить как можно больше контента (например, изображений, уравнений, HTML-таблиц и т. Д.). Решение должно быть в состоянии запускаться из командной строки. Хорошее решение также должно быть кроссплатформенным и в идеале минимизировать зависимости, чтобы упростить обмен make-файлами и так далее.

В частности, есть много вариантов:

Whether to convert RMD to MD to HTML to PDF; or RMD to MD to PDF; or RMD to PDF If using the markdown package in R, which options to specify Whether to use pandoc, a package built into R, or something else

Вот примеррмд файл это, по-видимому, обеспечивает разумную проверку любого предложенного решения. Он был использован в качестве основы дляэтот блог.