Parece bastante simples. Documentação emhttp: //velocity.apache.org/engine/devel/developer-guide.html#Configuring_Loggin diz para definir a propriedade runtime.log. Aqui está o que eu tenho para todas as minhas propriedades.

velocityEngine.setProperty(RuntimeConstants.FILE_RESOURCE_LOADER_PATH, templatesPath);

            velocityEngine.setProperty("runtime.log", "/path/to/my/file/velocity.log");
            velocityEngine.setProperty("resource.loader", "string");
            velocityEngine.setProperty("string.resource.loader.class", "org.apache.velocity.runtime.resource.loader.StringResourceLoader");
            velocityEngine.setProperty("string.resource.loader.repository.class", "org.apache.velocity.runtime.resource.util.StringResourceRepositoryImpl");

Não localize nenhum arquivo de log onde eu disse para colocá-lo e, em vez disso, localize os novos erros colocados no local antigo (pasta de inicialização). Alguma ideia? : D