Sincronização de muitos arquivos binários

Eu tenho cerca de 100.000 arquivos no servidor do escritório (imagens, PDFs, etc ...) A contagem diária de arquivos aumenta cerca de 100-500 itens e cerca de 20-50 arquivos antigos são alterados.

Qual é a melhor maneira de sincronizar o servidor da Web com esses arquivos? Qualquer sistema como o Mercurial, GIT pode ajudar? (No servidor do escritório, efetuarei alterações e o servidor da web periodicamente fará atualizações)?

O segundo problema é que no servidor Web tenho conteúdo gerado pelo usuário (arquivos binários) (outros arquivos). Todos os dias, esses usuários carregam entre 1000 e 2000 novos arquivos. Arquivos antigos não mudam. E preciso fazer backup desses arquivos na máquina local. Algum sistema como Merurial, GIT pode ajudar nessa situação? (No servidor da Web, confirmarei esses arquivos pelo cron e, na máquina local, atualizo)

obrigado

UPD.

O servidor do Office é o servidor Web do Windows Server 2008 R2, o Debian 5 lenny

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