Doxygen não encontrará cabeçalhos em subdir

Estou documentando os arquivos de cabeçalho de uma biblioteca C ++ com Doxygen. NoDoxyfileEu defini

INPUT = include/

na esperança de que o Doxygen gerasse documentação para todos os arquivos de cabeçalhoinclude/Foo, mas não: apenas oindex.html é gerado. Eu posso definirINPUT parainclude/Foo, mas a documentação lista os cabeçalhos com seus nomes de base (Reader.hh), enquanto eu quero que os clientes incluam os cabeçalhos comoFoo/Reader.hh etc.

Como faço para que o Doxygen procure dentro do subdiretório?

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