Então, segui o guia no site da Jekyll instalando e executando o Jekyll (com certeza não preciso postar isso aqui). E o site está funcionando perfeitamente, mas por algum motivo não vejo o_layouts diretório que deveria estar lá. Nas páginas, vejo que ele faz referência a alguns layouts, ou seja:

index.html

---
layout: default
---

<div class="home">

about.md

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layout: page
title: About
permalink: /about/
---

This is the base Jekyll theme.

Mas quando você olha para a estrutura de diretório do projeto:

Nenhuma pasta de layouts .. o que há com isso? Tudo funciona embora. E parece perfeitamente bem quando executado no localhost.