Me deparei com essa discussão (de um ano atrás):https://github.com/bokeh/bokeh/issues/2392

Eu também vi a tela branca sem erros .. e então eu tentei pegar um pequeno subconjunto de 2 colunas e tentei o abaixo:

Como os pandas também recebem um monte de linhas com dados vazios, tentei dropna .. isso resultou na inexistência de dados. Então, em vez disso, apenas especifiquei as linhas que devem entrar no df (daí odf = df.head(n=19) linha)

import pandas as pd
from bokeh.plotting import figure, output_file, show

df = pd.read_excel(path,sheetname,parse_cols="A:B")
df = df.head(n=19)
print(df)
rtngs = ['iAAA','iAA+','iAA','iAA-','iA+','iA','iA-','iBBB+','iBBB','iBBB-','iBB+','iBB','iBB-','iB+','iB','iB-','NR','iCCC+']
x= df['Score']
output_file("line.html")

p = figure(plot_width=400, plot_height=400, x_range=(0,100),y_range=rtngs)

# add a circle renderer with a size, color, and alpha
p.circle(df['Score'], df['Rating'], size=20, color="navy", alpha=0.5)

# show the results
#output_notebook()
show(p)

df:

   Rating  Score
0    iAAA   64.0
1    iAA+   33.0
2     iAA    7.0
3    iAA-   28.0
4     iA+   36.0
5      iA   62.0
6     iA-   99.0
7   iBBB+   10.0
8    iBBB   93.0
9   iBBB-   91.0
10   iBB+   79.0
11    iBB   19.0
12   iBB-   95.0
13    iB+   26.0
14     iB    9.0
15    iB-   26.0
16     NR   49.0
17  iCCC+   51.0
18   iAAA   18.0

O acima está me mostrando uma saída dentro do notebook, mas ainda lança:ValueError: Out of range float values are not JSON compliant

E também não produz (portanto?) O arquivo de saída também. Como me livrar desse erro para este pequeno subconjunto? Está relacionado aos valores de NaN? Isso também resolveria o problema da "tela branca da morte" para o conjunto de dados maior?

Obrigado vm por dar uma olhada!

Caso você queira ver o erro inteiro:

---------------------------------------------------------------------------
ValueError                                Traceback (most recent call last)
<ipython-input-12-4fa6b88aa415> in <module>()
     16 # show the results
     17 #output_notebook()
---> 18 show(p)

C:\Users\x\AppData\Local\Continuum\Anaconda3\lib\site-packages\bokeh\io.py in show(obj, browser, new)
    300     if obj not in _state.document.roots:
    301         _state.document.add_root(obj)
--> 302     return _show_with_state(obj, _state, browser, new)
    303 
    304 

C:\Users\x\AppData\Local\Continuum\Anaconda3\lib\site-packages\bokeh\io.py in _show_with_state(obj, state, browser, new)
    310 
    311     if state.notebook:
--> 312         comms_handle = _show_notebook_with_state(obj, state)
    313         shown = True
    314 

C:\Users\x\AppData\Local\Continuum\Anaconda3\lib\site-packages\bokeh\io.py in _show_notebook_with_state(obj, state)
    334         comms_target = make_id()
    335         publish_display_data({'text/html': notebook_div(obj, comms_target)})
--> 336         handle = _CommsHandle(get_comms(comms_target), state.document, state.document.to_json())
    337         state.last_comms_handle = handle
    338         return handle

C:\Users\x\AppData\Local\Continuum\Anaconda3\lib\site-packages\bokeh\document.py in to_json(self)
    792         # this is a total hack to go via a string, needed because
    793         # our BokehJSONEncoder goes straight to a string.
--> 794         doc_json = self.to_json_string()
    795         return loads(doc_json)
    796 

C:\Users\x\AppData\Local\Continuum\Anaconda3\lib\site-packages\bokeh\document.py in to_json_string(self, indent)
    785         }
    786 
--> 787         return serialize_json(json, indent=indent)
    788 
    789     def to_json(self):

C:\Users\x\AppData\Local\Continuum\Anaconda3\lib\site-packages\bokeh\core\json_encoder.py in serialize_json(obj, encoder, indent, **kwargs)
     97         indent = 2
     98 
---> 99     return json.dumps(obj, cls=encoder, allow_nan=False, indent=indent, separators=separators, sort_keys=True, **kwargs)

C:\Users\x\AppData\Local\Continuum\Anaconda3\lib\json\__init__.py in dumps(obj, skipkeys, ensure_ascii, check_circular, allow_nan, cls, indent, separators, default, sort_keys, **kw)
    235         check_circular=check_circular, allow_nan=allow_nan, indent=indent,
    236         separators=separators, default=default, sort_keys=sort_keys,
--> 237         **kw).encode(obj)
    238 
    239 

C:\Users\x\AppData\Local\Continuum\Anaconda3\lib\json\encoder.py in encode(self, o)
    197         # exceptions aren't as detailed.  The list call should be roughly
    198         # equivalent to the PySequence_Fast that ''.join() would do.
--> 199         chunks = self.iterencode(o, _one_shot=True)
    200         if not isinstance(chunks, (list, tuple)):
    201             chunks = list(chunks)

C:\Users\x\AppData\Local\Continuum\Anaconda3\lib\json\encoder.py in iterencode(self, o, _one_shot)
    255                 self.key_separator, self.item_separator, self.sort_keys,
    256                 self.skipkeys, _one_shot)
--> 257         return _iterencode(o, 0)
    258 
    259 def _make_iterencode(markers, _default, _encoder, _indent, _floatstr,

ValueError: Out of range float values are not JSON compliant