Posso substituir a configuração do PHP no htaccess ao usar o PHP-FPM?

Meu vhost fica assim:

<Directory "/var/www">
  Options Indexes FollowSymlinks MultiViews
  AllowOverride All
  Require all granted

  <FilesMatch "\.php$">
    Require all granted
    SetHandler proxy:fcgi://127.0.0.1:9000
  </FilesMatch>
</Directory>

Estou tentando adicionar linhas php_value ao meu arquivo .htaccess. Assim que recebo, recebo 500 erros, e isso no log de erros do meu Apache:

/var/www/.htaccess: Comando inválido 'php_value', talvez com erro de ortografia ou definido por um módulo não incluído na configuração do servidor

Então, a pergunta: Existe alguma maneira de substituir as configurações do php.ini via .htaccess, ao usar o PHP-FPM?

tia.

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