Eu procurei em vários fóruns e parece ser uma pergunta comum. No entanto, eu não consegui encontrar uma solução. Eu não fiz nada louco, então parece estranho que isso aconteça.

@Override
protected Scene onCreateScene() {
    Scene s = new Scene();
    PhysicsWorld mWorld=new PhysicsWorld(new Vector2(0, SensorManager.GRAVITY_EARTH),true);
    s.registerUpdateHandler(mWorld);
    final Sprite eliSprite = new Sprite(400, 240, james_walking[3], getVertexBufferObjectManager());
    eliSprite.setScale(0.5f);
    s.attachChild(eliSprite);
    s.setTouchAreaBindingOnActionDownEnabled(true);
    return s;
}

Eu não tenho muito mais a dizer, porque eu não sei muito sobre o Andengine, então uma explicação dos manequins seria apreciada. Depois de adicionar o que você disse, o erro desaparece, mas o PhysicsWorld ainda não funciona. O logcat diz

02-27 17:07:51.153    2590-2639/com.company.m.appname D/dalvikvm﹕ No JNI_OnLoad found in /data/data/com.company.m.appname/lib/libandenginephysicsbox2dextension.so 0x41cdce70, skipping init