Estou usando o RStudio para escrever documentos de remarcação e quero adicionar o sumário (TOC) na parte superior dos documentos para que o usuário possa clicar na seção relevante para leitura. Havia alguns exemplos relevantes nos rpubs, mas agora não consigo encontrá-los. Por favor note que eu não usopandoc e sou bastante novo emRmd & knitr. Existe alguma maneira de adicionar TOCs sem usarpandoc? Se estiver usandopandoc é necessário, então, quais funções são relevantes?

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Aqui está uma pequena página de exemplo:

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title: "Sample Document"
output:
  html_document:
    toc: true
    theme: united
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Header 1
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This is an R Markdown document. Markdown is a simple formatting syntax for authoring HTML, PDF, and MS Word documents. For more details on using R Markdown see <http://rmarkdown.rstudio.com>.

## Header 2
When you click the **Knit** button a document will be generated that includes both content as well as the output of any embedded R code chunks within the document. You can embed an R code chunk like this:

```{r}
summary(cars)
```

You can also embed plots, for example:

```{r, echo=FALSE}
plot(cars)
```
### Header 3
Note that the `echo = FALSE` parameter was added to the code chunk to prevent printing of the R code that generated the plot.

Tentei rodar isso no RStudio v 0.98.864 e funcionou! mas infelizmente não funcionou em 0.98.501 e 0.98.507. Estou trabalhando na minha tese em 0.98.501 e depois de atualizar o RStudio, algumas das minhas análises não funcionaram. Então, voltei a 0.98.501. O que eu deveria fazer agora? Eu realmente quero TOCs, mas sem prejudicar os resultados de outras análises.