Como configurar o R instalado pelo conda para uso com o RStudio?
Eu tenho tentado configurar meuR
usandoconda
(eventualmente para usar com o Beaker Notebook) e eu quero poder usarRStudio
com minha versão instalada pelo condaR
.
Meu método de instalaçãoR
:
conda install -c r r
conda install -c r r-essentials
conda install -c r r-rserve
conda install -c r r-devtools
conda install -c r r-rcurl
conda install -c r r-RJSONIO
conda install -c r r-jpeg
conda install -c r r-png
conda install -c r r-roxygen2
conda install --channel https://conda.anaconda.org/bioconda bioconductor-edger
Eu executei essa versão do R (instalei apenas esta versão)
> version
_
platform x86_64-apple-darwin11.0.0
arch x86_64
os darwin11.0.0
system x86_64, darwin11.0.0
status
major 3
minor 3.1
year 2016
month 06
day 21
svn rev 70800
language R
version.string R version 3.3.1 (2016-06-21)
nickname Bug in Your Hair
CorridaR
noJupyter
é meio buggy. Por exemplo, quando gera erros, gera parastdout
e divide todos os caracteres da string com uma quebra de linha. Eu quero usarRStudio
mas não quero instalar outra versão doR
.
Como rotear minha versão conda doR
no RStudio?
Aqui está o meu.bash_profile
não tenho certeza se isso será útil:
$ cat ~/.bash_profile
# added by Anaconda3 4.0.0 installer
export PATH="/Users/jespinoz/anaconda/bin:$PATH"
export RSTUDIO_WHICH_R=/Users/jespinoz/anaconda/bin/R
Eu tenho tentado seguir estes tutoriais, mas estou perdido. Eu realmente não estou muito familiarizado com variáveis de ambiente e essas coisas.
(1)https://support.rstudio.com/hc/en-us/community/posts/207830688-Using-RStudio-with-conda
2)Inicie o mac eclipse com o conjunto de variáveis de ambiente
quando eu olhei para o meuR
me direcionou para:
$ which R
/Users/jespinoz/anaconda/bin/R
mas as instruções de (1) estão usando esse caminho que é muito confuso:
/Users/jespinoz/anaconda/lib/R/bin/R
Eu tentei fazer o que esse cara fez e adicionei isso ao meu.bash_profile
mas não funcionou. Eu até fiz uma.bashrc
mas ainda não funcionou (eusourced
ambos depois que eu adicionei as linhas)
export RSTUDIO_WHICH_R=/Users/jespinoz/anaconda/bin/R
Como dizer ao RStudio para usar a versão R do Anaconda
Infelizmente,anaconda
não tem tutorial para isso emhttps://docs.continuum.io/anaconda/ide_integration