medo de cair retornos de carro em C?

Quero poder ler um arquivo de texto do Windows, modificá-lo na memória e substituir o arquivo antigo pelos dados modificados. No entanto, o medo não parece armazenar os retornos de carro presentes no meu arquivo de texto do Windows, o que está prejudicando quando escrevo sobre os dados antigos. Não consigo encontrar mais ninguém que pareça ter esse problema.

Aqui está um exemplo de código que demonstra o problema:

#include <stdio.h>
#include <stdlib.h>

int main()
{
    FILE* textFile;
    long fileSize;
    char fileCharacterBuffer[100];

    int i;
    for(i = 0; i < 100; i++)
    {
        fileCharacterBuffer[i] = '\0';
    }

    textFile = fopen("./Test.txt", "r+");

    fseek(textFile, 0L, SEEK_END);
    fileSize = ftell(textFile);
    fseek(textFile, 0L, SEEK_SET);

    fread(fileCharacterBuffer, 1, fileSize, textFile);
}

O arquivo de teste:

3
112
REd
110
green

#5/09/2014
5087 - 5/6/2014

Seu dump hexadecimal, que mostra seus EOLs, é \ r \ n:

Offset(h) 00 01 02 03 04 05 06 07 08 09 0A 0B 0C 0D 0E 0F

00000000  33 0D 0A 31 31 32 0D 0A 52 45 64 0D 0A 31 31 30  3..112..REd..110
00000010  0D 0A 67 72 65 65 6E 0D 0A 0D 0A 23 35 2F 30 39  ..green....#5/09
00000020  2F 32 30 31 34 0D 0A 35 30 38 37 20 2D 20 35 2F  /2014..5087 - 5/
00000030  36 2F 32 30 31 34 0D 0A                          6/2014..

Após o medo, o GDB imprime fileCharacterBuffer como:

"3\n112\nREd\n110\ngreen\n\n#5/09/2014\n5087 - 5/6/2014\n", '\000' <repeats 51 times>

Com apenas o \ n presente. O que?

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