Knitr: opts_chunk $ set () não funciona no comando Rscript
Estou usando o knitr para criar um arquivo de remarcação a partir do Rmd e tenho a seguinte opção definida na parte superior do meu script .Rmd para ocultar todos os resultados e plotagens:
```{r, echo=FALSE}
opts_chunk$set(results="hide", fig.show="hide")
```
Quando eu clico no botão Knit HTML no RStudio, isso funciona - eu recebo a saída sem os resultados e os números. Mas se eu executar a partir da linha de comando:
Rscript -e 'knitr::knit("myfile.Rmd")'
Parece que oopts_chunk$set()
A linha não é lida e recebo resultados e gráficos na minha saída .md. Eu resolvi o problema especificando essas opções no comando Rscript:
Rscript -e 'library(knitr); opts_chunk$set(results="hide", fig.show="hide"); knit("myfile.Rmd")'
Mas eu prefiro manter todas as opções lidas no arquivo que estou usando, em vez de especificar na linha de comando. Como obtenho as opções lidas no arquivo .Rmd quandoknit
com o Rscript na linha de comando?
Obrigado.