No Windows, no meu RProfile.site, eu costumava definir:

Sys.setenv(R_USER="/my/desired/path/to/tilde")

No entanto, isso não cria o mesmo efeito no Ubuntu. Alguma idéia de como eu posso conseguir o mesmo efeito? Tal que quando eu digito ~ em um caminho ele se expande para R_USER?

Aqui está um exemplo. No Windows, depois de definir R_USER, nos meus scripts, usaria o seguinte:

read.csv("~/Project") 

Onde "~" expandido para / alguns / caminho / para / projects /