JavaFX: Adicionando um novo nó ao Scene no código java quando o Scene é inicialmente carregado a partir do FXML

Como posso adicionar um novo nó ao Scene no código java quando o Scene é inicialmente carregado a partir do FXML? Eu carreguei de FXML como mostrado abaixo

Parent root = FXMLLoader.load(getClass().getResource("sample.fxml"));

Scene scene = new Scene(root, 1000, 600, Color.DODGERBLUE);

Agora, por exemplo, como faço para adicionar botão para a cena no código Java?

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