É possível verificar os subdiretórios de um repositório no Git?

Imagine que estou configurando uma nova instalação do WordPress. Vou criar dois novos diretórios para minha customização de plugins e temas:

Eu quero manter esses diretórios via Git. No Subversion, eu faria isso tendotrunk/myplugins/ etrunk/mytheme/ diretórios e verificando os subdiretórios. O Git tem uma maneira de realizar a mesma tarefa usando um único repositório?

Eu poderia estar perdendo o barco em algum paradigma Git, como um usuário SVN de longa data com pouca exposição ao Git.

Editar: Vários ramos O armazenamento de conteúdo diferente é uma maneira interessante de lidar com isso.