Debugging Closure-compilador Javascript compilado

Eu tenho um aplicativo dojo complexo que funciona corretamente uncompiled, mas depois de compilar com o GoogleCompilador de Fechamento, Tenho diferenças sutis em alguns comportamentos.

Como é, é extremamente difícil depurar, e não consegui encontrar nenhuma informação sobre possíveis diferenças funcionais entre o Javascript compilado e não compilado com o Google Closure.

Alguém pode me apontar na direção de diferenças conhecidas, ou compartilhar experiências semelhantes e algumas idéias de onde começar a procurar?

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